Ce n'est ni la BCF ni les presets testés qui sont responsable de ton problème mais une mauvaise configuration des tes préférences dans Cubase.
Tu dois décocher la case Activer l'enregistrement pour la piste selectionnée dans Fichier > Préférences > Edition sans quoi, le fait de selectionner une piste depuis ta BCF armera automatiquement l'enregistrement pour celle-ci au détriment de la précédente.
Rappelle toi toujours que le plus gros bug d'un ordi se trouve en face de l'écran ;)...