The Gimp
Et une fois que t'as choppé le coup, c'est relativement facile à faire.
Il suffit de rennommer les calques au format.
Par exemple: image1(100ms)(replace)
la 1er valeur est le temps d'apparition du calque, la deuxieme valeur le mode d'apparition (qui peut être aussi (combine) pour un rajout d'image)
A enregistrer en .gif pour la transparence, et c'est joué.
Facile, non?