C'est probablement que cette fréquence est restituée plus fort par ton ampli et/ou mieux captée par le micro de ta gratte et/ou que la caisse de celle-ci "vibre" mieux à cette fréquence et/ou que cette fréquence "résonne" mieux dans la salle ...
Donc si j'ai bien compris tu n'utilises que ton ampli gratte pour seule sonorisation et la sortie de ta table entre directement dans celui-ci ?
Ca te le fait aussi quand tu utilises seulement la guitare avec l'ampli ? (sans la table et sans micro supplémentaire).