Aaaaaaaaaaaaaaaah, ben c'est normal alors

il ne faut pas le formater avec le CD d'install, parce que ça va isntaller zindoz (d'ou son nom)
dans un premier temps il te faut créer une ou des partitions sur ton second disque avec la commande dos "fdisk".
ensuite ton/tes lecteurs seront visibles dans windows, et tu devrais pouvoir les formater (avec un clic droit sur le lecteur ou un truc du genre).
au pire si tu ne trouves pas la commande, tu fais un "format [lettre du lecteur]:" pour chaque lecteur que tu as créé sur le disque.
fdisk et format étant des commandes dos, il te faut démarer avec une disquette dos qui prenne en charge le lecteur CD. tu mets la disquette dans le lecteur, tu redémares ton pc, ça mettra un petit moment et après tu te retrouveras sous dos. tu tapes "fdisk" pour lancer l'utilitaire, et là tu auras la liste de tes lecteurs que tu pourras partitionner. attention, ne repartitionne pas le disque déjà formaté ou tu as installé windows !
après tu le formate soit depuis windows, soit depuis la même disquette de démarage avec la commande "format" (en choississant bien "ntfs" pour la "prise en charge des lecteurs de grande capacité")
si tu n'as pas de disquette de boot sous la main, tu peux en faire une avec un petit utilitaire que tu trouveras noralement sur le CD de windows 2000 (dans un répertoire "makeboot") et qui s'appelle "makeboot.exe"
dis moi si tu as des soucis...