Ben ça n'a rien à voir avec le fait que ça vienne d'un MD ou pas.
Une fois l'enregistrement dans ton ordi, pourvu qu'il soit dans un format non compressé, son édition ne changera rien à la qualité sonore. C'est si tu appliques des traitements que ça va commencer à bouger.
Après, il y a plein de choses à prendre en compte. Si tu es obligé de passer par une conversion AN/NA (si tu dois ré-enregistrer ton enregistrement sur l'ordinateur au lieu de simplement transférer le fichier), la qualité va dépendre énormément de la qualité sonore de ton lecteur et de celle de ta carte son.
De toutes façons, ces questions de qualité de son, c'est pas juste un point, c'est toute la chaîne audio. On a coutume de dire que la faiblesse d'une chaîne (audio) est déterminée par son maillon le plus faible. Après, c'est à nuancer. Il y a des points plus essentiels que d'autres. Par exemple, un enregistrement avec micro + préamp de tuerie sur une carte son de base sonnera surement mieux qu'un enregistrement sur une top carte son avec un micro et préamp de base.
Le bon son ne se pense pas que en terme de qualité (absence de souffle, de bruits, fréquence et bitdeph d'échantillonnage), mais aussi en terme de couleur, de chaleur, etc.
Personnellement, je préfère souvent un bon son bien rond, chaud, un peu gras avec un peu de ronflette ou de souffle qu'un son cliniquement clean, mais sans vie.